Daxter er helt igennem et platformspil med et twist af puzzle, hvilket er rart på den håndholdte spillekonsol.
Hvis man kan huske starten af Jak 2, hvor du bliver smidt ud af tidsmaskingen og andholdt i Havencity, mens Jak bliver andholdt undslipper Daxter, og det er begyndelsen på spillet.
Daxter løbber ind i en skadedyrsfirma hvor du bliver ansat som skadedyrsudryder, og du klare et par opgaver indtil du ser politet køre forbi dig og Jak er med den som fange. Efter det øjeblik begynder du på at rede Jak. og det sidste der sker er starten på Jak 2 da han bliver befriet.
Spillet giver et ekstra kapittel i Jak and Daxter serien.