Selvom Retro Studios opfølger længe har haft en officiel titel, så forlyder det nu fra Japan at man her omdøber spillet en smule. I stedet for at beholde titlen Metroid Prime 2: Echoes, så kaldes spillet nu i stedet Metroid Prime 2: Dark Echoes.
Det får ingen indvirkning på udgivelsesdatoen og det er kun den japanske version der vil få denne ændring. I Europa og USA vil spillet stadig være kendt som Metroid Prime 2: Echoes.