I hvad der har udviklet sig en noget forvirrende sag, har udvikleren Stardock fortalt via en længere postering på Steam, at de har fået påbud fra de originale udviklere af spilserien om at fjerne spillet fra Steam og Good Old Games. Stardock forsikrer dog dem der har købt Star Control: Origins om at spillet fortsat vil kunne spilles.
Sagen mellem Stardock og Paul Reiche III og Fred Ford har aner tilbage til 2013, hvor Stardock originalt lagde sag an mod de to originale udviklere efter Stardock havde købt rettighederne til Star Control-licensen. Dette kom i kølvandet på, at Reiche III og Ford annonceret en direkte fortsættelse til Star Control 2, kaldet Ghosts of the Precursors.
Stardock fortæller ligeså, at de grundet sagsmålet er blevet nødt til at afskedige end række medarbejdere. Selvom spillet selv er forsvundet, er diverse indholdspakker man kan tilkøbe stadig tilgængelige på Steam og Good Old Games. Hvordan fremtiden ser ud for Stardock og Star Control: Origins er fortsat uvist.
