Selvom at PvP i brede træk er valgfrit i store dele af Dune: Awakening, så er det stort set påtvunget i spillets endgame, hvor man befinder sig i zonen Deep Desert. Her er det kun omtrent 10% af det samlede map der er til PvE-indhold, men det står til at ændre.
Tilsyneladende grundet feedback fra spillere fra nær og fjern, så ændrer Funcom nu strategi. I et åbent brev siger instruktør Joel Bylos, at de ønsker at ekspandere PvE-delen til cirka 50% af Deep Desert.
"We still believe in the core concept of the Deep Desert — an endlessly renewing location that resets every week and creates an activity loop for great rewards. The tension of heading out there, head on a swivel, eyes peeled for foes as you enter the most dangerous part of the most dangerous planet in the universe. Our wish was that players would embrace this loop, forming guilds to work together to overcome the bleakness of the Deep Desert."
Det kommer snart til at være sådan at der er mange "Partial Warfare (PvE)"-områder, hvor spillere frit kan få fingrene i sjældne ressourcer uden frygt for andre spillere, mens de vigtigste Spice Fields, Shipwrecks og Landsraad Control Points forbliver PvP.