Udvikleren bag Total War: Warhammer II, Creative Assembly, har åbnet dørene for at modificere spillet gennem Steam Workshop. Teknisk set har det været muligt for brugerne at modificere spillet siden dets udgivelse, men udvikleren lukkede Steam Workshop tidligt, da modifikationerne påvirkede spillets stabilitet.
I skrivende stund er der næsten allerede 560 modifikationer i spillets Steam Workshop, hvoraf de mest populære er tilføjelsen af et bedre kamera samt mere realistiske bannere til din hær.